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sed 的非贪婪匹配
oracle数据库的中文字符...
RPM(TPM)和RPKM的计算
通过Kmer来估计基因组的...
lpr打印报错的问题
活着的基因注释平台
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命令行来调整大小写的几...
请没有买房和买车的朋友...
How to kill zombie pr...

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平淡之中的幸福点滴。...
发表人 starliu
发表时间 2011-12-26 10:49 PM
发表评论: 平淡之中的幸福点滴。米米的老公是那种细腻的双鱼,生活应该是平静而甜蜜的。。。享受婚姻享受幸福的女人最美丽

很少这么仔细的看完咸...
发表人 starliu
发表时间 2011-12-26 10:43 PM
发表评论: 很少这么仔细的看完咸的作品,因为在你的博文上所以仔细的看了。看完之后的感觉是观点颇为偏激,确实暴漏的问题的实质。不过确实迎合了一部分人的心里。 其实,我更关心的是,这99%的白领破产之后,中国将何去何从?

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 06:26 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 06:24 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 06:04 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 06:04 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 06:01 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 05:50 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 05:44 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工

专业生产管道不停输带...
发表人 rRSoToja
发表时间 2011-12-01 05:42 PM
发表评论: 专业生产管道不停输带压开孔机.承接管道不停输带压开孔施工



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晴天 sed 的非贪婪匹配   [ 2011-11-09 17:28:53  |  本站原创 ]

把NT库的Head提出来生成了一个文件,想把这个文件根据GI号为index导入到mysql里面,这样在以后的查询中可以方便的查到注释信息。

首先产生的head文件就是这样的:

>gi|4|emb|X17276.1| Giant Panda satellite 1 DNA



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:318

不知道什么原因,在bash中总是乱码。服务器端的设置是CHS16GBK,是正确的,没有问题。但是在bash里面,或者说是在Perl里面,全是问号,也没有什么报错信息。

后来在网上搜了一通,要在环境变量里面设置一个参数:

export NLS_LANG="SIMPLIFIED CHINESE_CHINA".ZHS16GBK



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:192
晴天 RPM(TPM)和RPKM的计算   [ 2011-10-28 11:07:55  |  本站原创 ]

之前自己用perl写了代码来计算RPKM值,现在又需要计算RPM值了,没办法,只能好好再重新来理解一下这些东西,然后再来计算了。

RPM,(Reads Per Million reads)即每百万读段中来自于某基因的读段数。

RPKM(Reads Per Kilo bases per Million reads)是每百万读段中来自于某基因每千碱基长度的读段数。



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:470

原来帮别人估计过基因组的大小,结果做完之后就忘记了。现在又要做这件事情了,诶。不做笔记害死人呀害死人。

jellyfish的使用方法还是不太理解。我只是基本会用吧。有些参数的设置可能也不正确。

首先说说我的步骤吧:



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:2 | 查看:296
晴天 lpr打印报错的问题   [ 2011-10-13 14:13:52  |  本站原创 ]

问题很奇怪,cups可以打开打印机,而且可以打印测试页。但是其它的程序就是找不到打印机,强行打印之后就报错。

与运行lpr之后的出错一样:
[code]$ lpr



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:1 | 查看:170
晴天 活着的基因注释平台   [ 2011-09-29 16:44:38  |  本站原创 ]

今天找了一下可以用于注释基因组的平台,找到好多,其中还活着的,并且是open source的有两个:

maker2 igs_manatee 写在这里做个记号。

最新的GenDB根本不提供源代码的下载地址,老的GenDB又会依赖KEGG,现在KEGG又开始收费了,估计重新安装会装不上了。



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:230

使用FTP的时候总是出现以上错误

是不是添加的PASV端口数量不够?

FTP用户数量多的时候会出现如下错误



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:366
晴天 命令行来调整大小写的几个办法   [ 2011-08-16 17:10:01  |  本站原创 ]

1. 用awk:

[code]$ echo TeSt | awk {'print tolower($_)'}
test



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:343

香港著名经济学家——郎咸平

       中国99%的白领以及他们的家庭即将面临破产。而且是必然破产!无路可逃!这件事可能是发生在未来2-10年。你可以尽量去怀疑这个数字。但它必然发生,绝非危言耸听。' 就如我预言中国国营企业职工必然失业一样,在当时来说没人信。但确实会发生。因为在中国这样一个发展中国家,其必然以不断的以通货膨胀和改革手段来换取经济的发展。而每一次改革所带来的阵痛都是由百姓来承担的。无论是上山下乡时迷茫的知青们还是改革开放带来的大量国企纷纷倒闭时大量下岗职工。如果他们能有一定的前瞻性的话,那么我想他们也许会为自己留一点后路。但是由于过分相信文件以及过分相信生活不会突变,所以才导致了他们的人生悲剧。 ­

­



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作者:cafeblue | 分类:心情日记 | 评论:2 | 引用:166 | 查看:779
晴天 How to kill zombie process   [ 2011-05-10 13:38:35  |  本站原创 ]

zombie process is hard to kill by "kill", I google a method to kill it.

sometime you have to find out the parent process and kill it, I think. 

The following command could be used to find out the defunct parent process.



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作者:cafeblue | 分类:软件技术 | 评论:0 | 引用:0 | 查看:528
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